Hoppa till huvudinnehållet
Till KTH:s startsida

CB204V Singelcell och spatiell transkriptomik-dataanalys 2,5 hp

Kursen fokuserar på bioinformatiska aspekter för singelcell och spatiell transkriptomisk analys.

Information per kursomgång

Termin

Information för HT 2025 Start 2025-10-27 fristående studerande

Studielokalisering

AlbaNova

Varaktighet
2025-10-27 - 2026-01-12
Perioder

HT 2025: P2 (2.5 hp)

Studietakt

17%

Anmälningskod

10193

Undervisningsform

Distans Dagtid

Undervisningsspråk

Engelska

Kurs-PM
Kurs-PM är inte publicerat
Antal platser

5 - 50

Målgrupp
Ingen information tillagd
Planerade schemamoduler
[object Object]
Schema
Schema är inte publicerat
Del av program
Ingen information tillagd

Kontakt

Examinator
Ingen information tillagd
Kursansvarig
Ingen information tillagd
Lärare
Ingen information tillagd

Kursplan som PDF

Notera: all information från kursplanen visas i tillgängligt format på denna sida.

Kursplan CB204V (HT 2024–)
Rubriker med innehåll från kursplan CB204V (HT 2024–) är markerade med en asterisk ( )

Innehåll och lärandemål

Kursinnehåll

Kursen består av föreläsningar och datorlabb. Föreläsningarna fokuserar på teoretiska aspekter av encellig och rumslig transkriptomisk analys. Datorlabb fokuserar på praktiska aspekter av båda ämnena. Specifikt innehåll i föreläsningarna:

  • reproducerbarhet om dataanalys
  • transkriptionell sprängning
  • arbetsflöde för singelcellsanalys 
  • arbetsflöde för spatiell transkriptomisk analys

Lärandemål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

  • bedöma skillnader mellan en single-cell och spatiell transkriptomisk analys
  • diskutera för- och nackdelar med båda typerna av analyser
  • utföra ett allmänt analysarbetsflöde av single-cell och spatiell transkriptomiska data

Kurslitteratur och förberedelser

Särskild behörighet

Kurser i cellbiologi, biokemi, mikrobiologi, genteknik eller molekylärbiologi 20 hp, 6hp matematik och engelska B/6.

Kurslitteratur

Du hittar information om kurslitteratur antingen i kursomgångens kurs-PM eller i kursomgångens kursrum i Canvas.

Examination och slutförande

Betygsskala

P, F

Examination

  • LAB1 - Jobbar i R, 0,5 hp, betygsskala: P, F
  • LAB2 - Single-cell analys, 1,0 hp, betygsskala: P, F
  • LAB3 - Spatiell analys, 1,0 hp, betygsskala: P, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

Övriga krav för slutbetyg

Närvaro vid datorlaboration är obligatorisk såväl som vid föreläsningar.

Examinator

Etiskt förhållningssätt

  • Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
  • Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
  • Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ytterligare information

Kursrum i Canvas

Registrerade studenter hittar information för genomförande av kursen i kursrummet i Canvas. En länk till kursrummet finns under fliken Studier i Personliga menyn vid kursstart.

Ges av

Huvudområde

Bioteknik

Utbildningsnivå

Avancerad nivå

Övrig information

Överlappar delvis med BB2250.

OSZAR »